تحليل RNA-seq
التعبير الجيني التفاضلي، تحليل التضفير، اكتشاف جينات الاندماج، وإثراء المسار من بيانات تسلسل RNA الكمي. يدعم استراتيجيات المحاذاة DESeq2 و edgeR و STAR/HISAT2.
Request Analysisخدمات علم الأحياء الحسابي من البداية إلى النهاية مدعومة ببنية HPC و GPU. من تحليل التسلسل إلى اكتشاف الأدوية — نتولى الحسابات، وأنت تركز على العلم.
خطوط تحليل شاملة لبيانات تسلسل الجيل التالي، من قراءات FASTQ الخام إلى الرؤى البيولوجية.
التعبير الجيني التفاضلي، تحليل التضفير، اكتشاف جينات الاندماج، وإثراء المسار من بيانات تسلسل RNA الكمي. يدعم استراتيجيات المحاذاة DESeq2 و edgeR و STAR/HISAT2.
Request Analysisتسلسل الترسيب المناعي للكروماتين لرسم خرائط تفاعلات البروتين-DNA، تعديلات الهيستون، ومواقع ربط عوامل النسخ مع استدعاء القمة وتحليل الموتيف.
Request Analysisتسلسل الترسيب المناعي DNA:RNA لرسم خرائط R-loop على مستوى الجينوم، تحديد العناصر التنظيمية، وتحليل تضارب النسخ-التكرار.
Request Analysisتحديد ملف التعبير الجيني المكاني مع الحفاظ على بنية الأنسجة. يدعم منصات Visium و Slide-seq و Stereo-seq مع فك التلافيف لنوع الخلية وتحديد المجال المكاني.
Request Analysisتحليل scRNA-seq و scATAC-seq والخلية الواحدة متعدد الوسائط بما في ذلك التجميع غير الخاضع للإشراف، استنتاج المسار، تعليق نوع الخلية، والتكامل عبر العينات.
Request Analysisاستدعاء SNP/indel، اكتشاف المتغيرات الهيكلية، تغيير عدد النسخ، وعلم الوراثة السكانية من بيانات تسلسل الجينوم الكامل قصيرة أو طويلة القراءة.
Request Analysisتجميع جينوم عالي الدقة وجينوميكس مقارنة باستخدام استراتيجيات التسلسل طويلة القراءة والهجينة.
تجميع جينوم بدرجة مرجعية من PacBio HiFi أو Oxford Nanopore أو بيانات هجينة. يشمل السقالات، ملء الفجوات، تعليق التكرارات، وتقييم جودة BUSCO الشامل.
Request Analysisبناء وتحليل pan-genomes عبر سلالات أو أنواع متعددة لالتقاط التنوع الجينومي، بنية الجينوم الأساسي/الملحق، وتحديد التسلسل الجديد.
Request Analysisالبيولوجيا الهيكلية الحسابية من التنبؤ بهيكل البروتين إلى تحليل التفاعل الجزيئي الكبير.
التنبؤ بهيكل البروتين على أحدث طراز باستخدام AlphaFold2/3، بما في ذلك التنبؤ بالمتعدد، تسجيل الثقة (pLDDT/PAE)، والتحقق الهيكلي مع التحليل النهائي.
Request Analysisمحاكاة MD طويلة المدى الزمني للبروتينات والأحماض النووية والمعقدات الجزيئية الكبيرة باستخدام GROMACS أو AMBER مع تسريع GPU، تحليل RMSD/RMSF، وتجميع المسار.
Request Analysisإرساء جامد ومرن للجزيئات الصغيرة على أهداف البروتين باستخدام سير عمل AutoDock Vina أو Schrödinger، مع تحليل وضع الربط وتقدير تقارب الربط MM-GBSA.
Request Analysisخطوط اكتشاف الأدوية الحسابية التي تدمج النهج القائم على الهيكل والليجند لتحديد الهدف وتحسين الرصاص.
حسابات طاقة الربط الحرة المعتمدة على MD (FEP/TI)، تحديد الموقع الأليستريكي، اكتشاف الجيب الخفي، وتحليل مرونة البروتين لتوصيف هدف الدواء المتحقق منه.
Request Analysisفحص افتراضي واسع النطاق لمكتبات كيميائية (ملايين المركبات) ضد أهداف الأدوية باستخدام الإرساء، تصفية الفارماكوفور، ووظائف التسجيل المعتمدة على ML.
Request Analysisتحليل مستقل عن المزرعة للمجتمعات الميكروبية من العينات البيئية والسريرية.
تسلسل أمبليكون 16S/18S/ITS وميتاجينوميكس البندقية للتصنيف التاكسونومي (Kraken2، MetaPhlAn)، التعليق الوظيفي (HUMAnN3)، تنوع ألفا/بيتا، وتحليل الوفرة التفاضلية.
Request Analysisنصمم وننفذ خطوط أنابيب علم الأحياء الحسابي المخصصة لسؤالك البحثي المحدد. اتصل بنا لمناقشة خطة تحليل مخصصة.
ناقش الخدمات المخصصة